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免疫期间一是要加强畜禽饲养管理，保持环境安静和卫生，落实防暑降温措施，避免相互追赶、撕咬和受到惊吓，减少畜禽的应激反应。二是要强化栏舍四周及饲养管理用具的消毒，做好粪便及病死畜禽的无害化处理，防止疫病发生。三是免疫前后7天尽量不使用***、抗病毒、抗球虫等药物，可适当在饮水中添加电解多维、维生素C、维生素E等抗应激药物，可以缓解和降低各种应激反应，提高免疫的效果。检测人员水平有限和检测操作不够细致到位，容易造成人为检测误差。检测试剂盒的质量问题也会影响抗体水平检测准确性。
作为较新的检测技术，近年来基因芯片被广泛应用与优化，更高效、更稳定。魏春霞等根据已知的7种牛易感病原核酸序列，利用多重PCR方法，通过肉眼观察芯片显色程度后，对芯片技术进行优化，建立了具有高通量、高灵敏度、高特异性等特点的基因芯片检测方法。该方法可在3h内同时检测牛7种病原间无交叉反应，所有芯片可重复使用，且芯片在2～8℃条件下能保存半年以上，可满足一般实验室的样品检测及流行病学监查，同时重复使用也可降低成本。刘志鹏等建立了可鉴定和区分口蹄疫病毒O、A和AsiaⅠ型3种血清型的分型芯片，灵敏度比常规PCR高10～100倍，特异性也较高，芯片可重复使用，保存3个月以上。
