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关 键 词:武汉FFPE核酸提取试剂盒
行 业:化工 化学试剂
发布时间:2022-11-02
FFPE样本DNA提取试剂盒,不会引入由于提取环节的不标准而导致的实验偏差。适用多种组织样本,采用纳米磁珠和特制的缓冲液系统,可从FFPE样品中提取高质量的基因组DNA。
FFPE样本DNA提取试剂盒中常用的法脱蜡法的过程和问题:
目前应用在成熟试剂盒中的脱蜡方法主要是溶剂脱蜡法,其中脱蜡法由于其脱蜡彻底的特性,较广泛的应用在疾病研究中。
在脱蜡法中,需要将石蜡包埋组织浸泡在溶液中进行脱蜡,后面经过两次高温处理,每次各一个小时,分别在56℃和90℃。在此期间结合消化缓冲液和蛋白酶K来消化组织,同时利用梯度乙醇来疏松组织结构、促进消化液渗入并去除组织中痕量。
FFPE样本DNA提取试剂盒的产品优势:
1、高纯:提取基因组DNA产量高、纯度好,蛋白和RNA污染低;
2、兼容:适用于各种不同FFPE组织样本及低质量样本的提取;
3、安全:操作简单,无酚、氯仿等溶剂;
4、自动化:兼容手动提取及自动化提取程序。
FFPE样本DNA提取试剂盒的应用:
福尔马林由于可以与蛋白氨基发生不可逆交联,所以对保持组织细胞结构的完整性、抗原可测定性、组织渗透性方面均优于其他固定液。因此,FFPE技术长期以来在检验、科学研究中得到广泛应用,尤其是细胞形态学研究和病理学研究。随着这几年分子诊断领域的不断发展,FFPE技术也越来越多的被应用在对疾病进行分子诊断。
随着基因组学检测技术的快速发展,尤其新一代测序技术 (NGS) 的飞速发展,在细胞分子水平提供了新的的检测能力,研究人员可以使用这一技术手段,重新开启FFPE样本宝藏的大门,寻找疾病与基因关系,进而去解释疾病的未解之谜。然而,在FFPE组织标本的制备和贮存过程中,组织经福尔马林固定、石蜡包埋后很容易引起DNA的交联和降解,研究人员很难获得足量的高质的DNA样本,这也对新的检测技术提出新的要求。
FFPE样本DNA提取试剂盒的常见问题分析及解决方法:
从前处理、提取、建库到测序分析,FFPE样本常见问题复杂多样,其中绝大部分问题和样本直接相关,可以通过回溯实验过程及分析来优化实验。
1、文库复杂度低
原因:样本质量差:测序深度太高;
优化方法:规范前处理、核酸提取过程;检查设备状态等;调整测序深度。
2、文库片段短
原因:样本质量差;打断时间过长
优化方法:规范前处理;调整打断时间。
3、文库总量低
原因:核酸投入/杂交投入量低;样本质量差;实验操作不规范;
优化方法:投入足够量的核酸,规范实验操作。
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