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关 键 词:自动化提取
行 业:化工 化学试剂
发布时间:2022-09-28
FFPE样本DNA提取试剂盒无有害试剂,提高实验的安全性;自动化提取满足不同通量需求,显著提高生产率;更大程度减少手工操作时间。
FFPE样本DNA提取试剂盒使用中为什么要脱蜡?
如果要对FFPE组织进行分子生物学研究,开始的就是要进行DNA的提取。 但是固定剂的交联作用对核酸是有害的,福尔马林石蜡和交联作用会妨碍核酸的提取,抑制DNA聚合酶的活性从而影响PCR扩增。除此之外,石蜡阻碍消化液对组织的渗透,从而抑制蛋白酶K和组织内蛋白的接触,影响组织消化和DNA释放。所以为了消除石蜡对DNA提取和PCR扩增的不良影响,必须在保证不增加外源性PCR抑制因子,并尽量减少DNA额外损伤的前提下对组织进行彻底脱蜡。
FFPE样本DNA提取试剂盒的常见问题分析及解决方法:
从前处理、提取、建库到测序分析,FFPE样本常见问题复杂多样,其中绝大部分问题和样本直接相关,可以通过回溯实验过程及分析来优化实验。
1、文库复杂度低
原因:样本质量差:测序深度太高;
优化方法:规范前处理、核酸提取过程;检查设备状态等;调整测序深度。
2、文库片段短
原因:样本质量差;打断时间过长
优化方法:规范前处理;调整打断时间。
3、文库总量低
原因:核酸投入/杂交投入量低;样本质量差;实验操作不规范;
优化方法:投入足够量的核酸,规范实验操作。
福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)是组织样本常见的保存方式,FFPE样本DNA提取试剂盒采用具有特有分离作用的纳米磁珠和特制的缓冲液系统,可从FFPE样品中提取高质量的基因组DNA。
FFPE样本DNA提取试剂盒的操作过程便捷,提取的核酸得率高,质量稳定可靠,可供PCR、实时荧光定量PCR、二代测序等使用。FFPE样本DNA提取试剂盒是基于磁珠法的分离系统,适用于高通量的自动化提取流程。
FFPE样本DNA提取试剂盒的产品特点:
1、基于纳米磁珠的提取纯化技术;
2、高载量,高提取效率;
3、适合手工提取及自动化工作站使用; 操作便捷;
4、提取产物可用于PCR、实时荧光定量PCR、二代测序等。
随着基因组学检测技术的快速发展,尤其新一代测序技术 (NGS) 的飞速发展,在细胞分子水平提供了新的的检测能力,研究人员可以使用这一技术手段,重新开启FFPE样本宝藏的大门,寻找疾病与基因关系,进而去解释疾病的未解之谜。然而,在FFPE组织标本的制备和贮存过程中,组织经福尔马林固定、石蜡包埋后很容易引起DNA的交联和降解,研究人员很难获得足量的高质的DNA样本,这也对新的检测技术提出新的要求。
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