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在PCR实验室净化中，需要保证运行区域内速度场的均匀性。这种一致性有两个主要原因:通风柜排气口位置不符合工艺特点，如热期下排气口，冷期上排气口。通风柜布局不当，比如经常打开的门窗附近的通风柜。一种情况，因为化学实验室的工艺通常是不确定的，所以在PCR实验室净化中推荐使用同时吸入的通风柜。在第二种情况下，应与土建密切配合，以满足通风的需要。通风柜操作口的入口风速也是设置通风柜排风系统的重要参数，与工艺和类型密切相关。
各种空气过滤器:过滤器按其处理空气的性能可分为粗效、中效、高效、次高效、高效、超高效六大类。每个过滤器处理灰尘颗粒的能力不同，因此它们用于不同的功能部分。如果选择正确，使用合理，就能发挥作用；否则，他们会适得其反。风机和送风风道:送风风机一般位于空调机组内。风机应根据整体风管和空调通风量来选择。大压头虽然可以满足克服系统阻力的要求，但会增加能耗和噪音。比较好的选择是考虑变频风机J，可能会加大投入，但是可以根据系统阻力的变化自动调节送风量，并且可以节能降噪。送风管道应做好保温降噪，必要时应加装消声装置。
实验室净化工程不仅起到保护实验样品安全的作用，也是保证实验成功和实验人员安全的重要措施之一。实验室净化工程是将实验室的某一区域开辟出来，专门用于建造空气洁净，对实验环境要求相对较高的实验室或无菌室。实验室净化工程系统其实和传统的洁净室系统差不多，只是洁净室的压力、微生物控制、温湿度控制比工业洁净室更严格。常见的实验室净化工程装修材料有夹层彩钢板、钢化玻璃、防火板等。洁净实验室必须按照洁净室施工及验收标准，采用密封性好、不产生粉尘的材料进行隔断和吊顶装修。洁净实验室的通风系统一般采用组合式空调机组。
