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由于免疫胶体金技术具有以上诸多优点，因此被广泛应用在兽医临床疾病诊断中，主要包括2个方面的内容：一是用于抗体的检测，二是用于病原的检测。
在抗体检测过程中，免疫胶体金诊断的基本原理为相应的抗原包被在纤维素膜（NC膜）上，用胶体金标记相应抗原，如果检测样品为阳性，那么样品中的抗体与NC膜上的抗原或金标抗原结合发生反应，出现红色线条或点，如样品为阴性，则没有上述现象出现。大量研究证明，在动物诸多疾病的抗体检测中，应用免疫胶体金技术符合率、灵敏度和特异性都比较好。
对于高风险、高致病性的畜禽疫病，可采用接种疫苗进行预防。我国畜牧业监管部门对于常见多发疫病都有免疫密度和免疫抗体合格率的具体要求。免疫抗体检测技术可用于检验畜禽接种疫苗的免疫程度，通过多克隆抗体检测技术、单克隆抗体检测技术等研究免疫效果，为疫苗接种效果提供评价依据。通过免疫抗体检测技术对某一地区的禽流感和家畜口蹄疫抗体水平进行检测，可以准确直观地反映该地区的畜禽重大，疫病疫苗的免**况，对接种疫苗的效果进行评价。
