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洁净实验室使用的空调通风系统主要由空气处理设备、粗高效过滤器、空气输送设施和局部净化设备组成，它们的类型和功能各不相同。空气处理设备:一般空气处理设备是由空调(AHU)、新风机组(MAU)、循环机组(RAU)组成的成套机组，常用于空调净化系统中的空气热湿交换和空气净化处理。适合有一定规模的实验室净化工程，但是需要其他过滤器和净化装置的整体配合，所以投资比较高。相对较小的实验室空气处理设备由分立的小型设备组成，比如利用冷暖空调作为冷热源，对空气的温湿度进行简单的处理，然后配备风机过滤机组(FFU)对空气进行净化，这是一种相对简单的净化方案。
各种空气过滤器:过滤器按其处理空气的性能可分为粗效、中效、高效、次高效、高效、超高效六大类。每个过滤器处理灰尘颗粒的能力不同，因此它们用于不同的功能部分。如果选择正确，使用合理，就能发挥作用；否则，他们会适得其反。风机和送风风道:送风风机一般位于空调机组内。风机应根据整体风管和空调通风量来选择。大压头虽然可以满足克服系统阻力的要求，但会增加能耗和噪音。比较好的选择是考虑变频风机J，可能会加大投入，但是可以根据系统阻力的变化自动调节送风量，并且可以节能降噪。送风管道应做好保温降噪，必要时应加装消声装置。
实验室净化工程不仅起到保护实验样品安全的作用，也是保证实验成功和实验人员安全的重要措施之一。实验室净化工程是将实验室的某一区域开辟出来，专门用于建造空气洁净，对实验环境要求相对较高的实验室或无菌室。实验室净化工程系统其实和传统的洁净室系统差不多，只是洁净室的压力、微生物控制、温湿度控制比工业洁净室更严格。常见的实验室净化工程装修材料有夹层彩钢板、钢化玻璃、防火板等。洁净实验室必须按照洁净室施工及验收标准，采用密封性好、不产生粉尘的材料进行隔断和吊顶装修。洁净实验室的通风系统一般采用组合式空调机组。
