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在设计前，应了解流程类型，并采用合适的入口风速。在PCR实验室净化，如果风速太低，有害气体可能无法完全消除；风速过高会增加能耗，影响柜内工艺操作，如电炉正常加热，溶剂蒸发加速。通风柜应根据不同种类的测试分成不同的系统。一般每个PCR实验室净化系统至多只能有四个通风柜，注意不要把强酸、强氧化剂和易燃易爆系统混在一个PCR实验室净化系统中。尽量使用补风通风柜，可以减少70%左右的排烟热损失。
为了保证实验过程无差错，很多实验室在建设实验室时，对洁净度水平的要求都很高。除了洁净实验室的要求，布局的设计和规划也很重要。洁净实验室设计规划布局有哪些方面？洁净实验室有时是单独建设，有时是整体实验室建设的一部分。洁净实验室的区域也可以分为清洁区、准清洁区、辅助区三个部分。洁净实验室的设计布置包括平面布置、净化路线和通风管道。洁净实验室平面设计规划与布局：洁净实验室平面设计规划布局根据洁净区、准洁净区、辅助区的位置不同，分为外廊环绕型、内廊型、两端型、核心型。
实验室净化工程不仅起到保护实验样品安全的作用，也是保证实验成功和实验人员安全的重要措施之一。实验室净化工程是将实验室的某一区域开辟出来，专门用于建造空气洁净，对实验环境要求相对较高的实验室或无菌室。实验室净化工程系统其实和传统的洁净室系统差不多，只是洁净室的压力、微生物控制、温湿度控制比工业洁净室更严格。常见的实验室净化工程装修材料有夹层彩钢板、钢化玻璃、防火板等。洁净实验室必须按照洁净室施工及验收标准，采用密封性好、不产生粉尘的材料进行隔断和吊顶装修。洁净实验室的通风系统一般采用组合式空调机组。
