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在种苗生产过程中重要的工作是水分管理。
尤其是四角和盘边的孔穴，一定要与中间的孔穴一样，基质不能装的过满，装满后各个格室应能清晰可见。
穴盘苗生产水分管理一般以子叶展开为分界线。
在子叶展开之前的水分管理比较简便，即要穴孔基质的下半部一直保持湿润。仅仅控制穴孔上半部分基质的干湿交替即可。
育苗穴盘的穴孔形状主要有方形和圆形，方形穴孔所含基质一般要比圆形穴孔多30%左右，水分分布亦较均匀，育苗盘，种苗根系发育更加充分。草莓育苗盘属于加深型，更适合根系发达的植物。
穴盘育苗由于统一播种和管理，使小苗生长发育一致，提高种苗品质， 有利于规模化生产。
经过清洗并消毒的穴盘，亦可以重复使用
穴盘育苗培育的秧苗具有苗龄短、幼苗整齐、健壮
育苗穴盘的穴孔形状主要有方形和圆形，方形穴孔所含基质一般要比圆形穴孔多30%左右，水分分布亦较均匀，蚕蛹孵化盘育苗盘，种苗根系发育更加充分。标准穴盘的尺寸为540mm×280mm
穴盘育苗的秧苗，其根坨呈上大下小的四棱锥体，故又称为“塞子苗”，采用穴盘育苗培育的秧苗具有苗龄短、幼苗整齐、健壮、无病虫害、定植后还苗快等优点
苗期管理。移苗补缺：出苗后要及时将苗床上覆盖的地膜揭去，辣椒育苗盘，防止揭膜过迟而形成“高脚苗”。待子叶展开后就要立即进行间苗和移苗补缺，将单多余的苗拔起移入缺苗的空，同时将多余的苗删除
