工厂化生产，取决于你需要生产的品种。通用的仪器一般有冰箱，灭菌锅，、三角瓶和摇床，无菌操作间，离心机，压滤机，小发酵罐（种子罐），大型发酵罐+蒸汽管道等等。
全自动发酵罐系统加工精细光洁、无死角、无沙眼、清洗方便，排空后无残留物。主要由发酵罐罐体、发酵控制系统及管路系统三部分组成。其材质、结构、布局完全按照发酵系统设计，罐体系统配有所需的发酵罐、蠕动泵、循环泵、控制阀、操作平台、管路系统、控制系统，充分考虑系统的安全性、可靠性；还配置了空气、蒸汽和水的预处理系统，在完成安装调试后，只需接入蒸汽、空气、水源和电源就可进行发酵运行。
发酵工程的应用范围工业，食品工业，能源工业，化学工业，农业：改造植物基因；生物固氮；工程杀虫菌生物农药；微生物养料。环境保护等方面。
有机肥料在日常生活中是很常见的，有机肥料可以改良土壤结构和土壤微生态系统，同时还能修复土壤，发展有机农业、绿色农业，实现上述功能的根本措施是使用有机肥料。目前，利用粪便制作的有机肥料往往是对粪便进行简单的搅拌晾晒或堆积，同时粪尿中的含有较多的淤泥、氮和磷，这样粪便产生的臭气和有害病菌容易对环境造成二次污染，给人们的生活带来了不便。
