发酵工程的应用范围工业，食品工业，能源工业，化学工业，农业：改造植物基因；生物固氮；工程杀虫菌生物农药；微生物养料。环境保护等方面。
全自动发酵罐系统加工精细光洁、无死角、无沙眼、清洗方便，排空后无残留物。主要由发酵罐罐体、发酵控制系统及管路系统三部分组成。其材质、结构、布局完全按照发酵系统设计，罐体系统配有所需的发酵罐、蠕动泵、循环泵、控制阀、操作平台、管路系统、控制系统，充分考虑系统的安全性、可靠性；还配置了空气、蒸汽和水的预处理系统，在完成安装调试后，只需接入蒸汽、空气、水源和电源就可进行发酵运行。
工厂化生产，取决于你需要生产的品种。通用的仪器一般有冰箱，灭菌锅，、三角瓶和摇床，无菌操作间，离心机，压滤机，小发酵罐（种子罐），大型发酵罐+蒸汽管道等等。
肥料是农业生产不可或缺的主要生产资料之一，传统的有机肥多来自单一粪便及绿肥植物等材料，长期以来，有机肥一直是以农户为单位分散制备，方法简单、处理水平低、肥料养分浓度低、体积大、质量不稳定、施用不方便，无法适应现代农业发展要求，我国现有耕地20亿亩，年需化肥1.5亿吨，是很大的化肥进口国和氮肥生产国，农业生产已离不开化肥的投入，但化肥长期大量、不合理的施用，也出现了土壤有机质含量降低，化学残留加剧，物理机构恶化、土壤板结严重，盐碱化程度加剧，综合肥力退化，有益微生物菌群遭受破坏等一系列的问题，对农业的可持续发展产生严重的制约，而随着有机食品、的市场需求的增长，生产推广有机肥料，发展有机肥料已成为必然趋势。
