所谓冻干机的自动控制应该包括二个部分，一是冻干机的各设备按冻干工艺要求在规定的时间自动走停，二是冻干箱板层温度按冻干曲线要求自动跟踪，整个冻干进程不需要人工操作，当然如果需要也可进行人工干预。但有些冻干机的自动控制是不完全的，仅能自动跟踪冻干曲线，其余部分需人工操作。
有些冻干机的自动控制仅能到冻干结束，冻干结束之后的箱内压塞、冷凝器除霜以及蒸汽消毒不能自动进行，需要人工操作，特别是蒸汽消毒部分，因涉及到许多阀门控制，人工操作比较麻烦，应该选择自动消毒程序的冻干机。
有些冻干机的自动控制是使用微机，操作、编程方便，显示的语言是冻干语言，还带有荧光屏，打印机和软盘，能同时储存几十个冻程序，每个程序内容可显示，整个程序内容可由打印机打出。而有冻干机的自动控制使用的是一种仪表，操作、编程均较麻烦，可储存的冻干程序也较少。
记录仪表对冻干机来说也是一个很重要的仪器，它能把整个冻干的实际过空地记录下来，以便日后存查，记录仪表大都采用多点记录仪，它既能打点，又能直接进行文字记录，还有数字显示系统。
冻干机会不会成为家家都有的一个机器？ 物随其名，将物品干燥并且冷冻的一种机器，而一次偶然的发现，有可能将冻干机推入家用电器的行列。
二手冻干机在哪些方面有着良好的运用，冷冻干燥是一个稳定化的物质干燥过程。是将含水的物质，先冻结成固态，而后使其中的水分从固态直接升华变成气态排除，以除去水分而保存物质的方法。
二手冻干机将制冷系统、真空系统、导热油加热系统、排湿系统组合一体，一种新型箱体结构，较大地利用箱体内存放物料空间进行干燥的冷冻真空干燥，可使干燥后粉体拥有良好的分散性。
冻干技术的运用：
1生物制品、药品方面：如素、抗、诊断用品和疫苗的保存。
2微生物和藻类方面：如各种、酵母、酵素、原生动物、微细藻类等的长期保存等。
3生物标本、生物组织方面：如制作各种动植物标本，干燥保存用于动物异种或同种移植的皮肤、角膜、骨骼、主动脉、心瓣膜等边缘组织。
4制作用于光学显微镜、电子扫描和透射显微镜的小组织片。
5食品的干燥方面：如咖啡、茶叶、肉鱼蛋类、海藻、水果、蔬菜、调料、豆腐、方便食品等。
6营养品及中草面：如蜂王浆、蜂蜜、花粉、中草药制剂等。
7超细微粉的制备方面：如制取Al2O3、ZrO2、TiO2、Ba2Cu3O7～8、Ba2Ti9O20等超细微粉。
8其他方面：如化工中的催化剂，冻干后可提高催化效率5～20倍；将植物叶子、土壤冻干保存，用以研究土壤、肥料、气候对植物生长的影响及生长因子的作用；潮湿的木制文物、淹坏的书籍稿件等用冻干法干燥，能大限度地保持原状等。
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冻干食品的出现，有可能会让冻干机加入我们家用电器的行业，也许你会说我这个想法太过虚幻，冻干机售价太贵，另一点普通家庭根本不需要购买冻干机，而我想说，刚开始发明出来的电脑不也是一样的贵，发展到现在挨家挨户都有电脑，不也是当初无法想象的么？对于冻干机有可能加入家电类别也是有依据的，据，我们所食用的水果或者饭菜（特别是海鲜）在冰箱内无法完全防止的滋生，在冰箱内的食品大约一星期过后含油量就超过了13%，但是经过冻干机冻干后的食品，不仅它的营养价值没有减少，而且会使它的储存更方便，更不容易产生滋生。对于现代的冻干机而言，冻干食物肯定是不成问题，但是它的体积太大和造价贵成了它不能迈入家庭的绊脚石，我相信在不久的未来，冻干机会像电脑一样，体积减少，而且造价便宜，成为人人喜爱的家电。
