功能模块层
该层主要是实现公共卫生环境监测管理系统的各项业务功能，包含系统权限管理功能、环境质量监测功能、污染源的数据管理功能及统计报表功能等。该层中的各个功能模块，通过 API 接口访问储存在各类数据库中的数据信息，由于数据库中的数据信息，数量庞大而且单纯枯燥，需要利用所设计各个模块的功能对数据库中的数据，进行分析识别，以实现各个模块功能。 [3]
Web 界面层
该层主要完成公共卫生环境监测管理系统中与用户交互相关操作，利用浏览器的HTML页面、CSS样式表、页面表单等将用户所需的数据信息展示在用户前面。用户通过浏览器提交HTTP服务请求，通过公共卫生环境监测管理系统数据库对客户请求进行处理，并将处理后的结果返回给浏览器，将简洁易懂的表格或者图形显示给用户。
数据库层
该层包含不同类别的数据库，其完成的功能是将数据采集层采集到的庞大数据信息进行分类储存，储存与各类数据信息相对应的数据库中，以方面功能模块层对其储存的数据进行访问、分析、处理等。环保部门工作人员可通过网络操作网页服务器来处理数据采集层传送的数据，完成公共卫生环境监测系统的各项业务功能。从现场数据采集层传输过来的数据信息，会造成数据积累，庞大的数据信息会导致数据库查询等操作效率降低，因此，设计巧妙的数据库层，提高数据库使用效率，成为该系统设计的一个关键问题。
我国环境监测信息管理系统(EMIS)建设起步比较晚，自 1973 年以来，我国 提出了将环境建设与经济建设协同发展、共同进步，并将环保工作定为我国的基本国策，由此我国开始探索建立环境监测管理机制。经过多年的努力，我国环境监测信息管理系统(EMIS)的研究和应用在二十一世纪后得到迅猛发展，并经历了不同的时段：环境信息标准化时段；省部级系统建设时段；城市级系统建设时段；环境监测管理广域网建设时段。
EMIS系统简述
此信息平台以国家环保局、各省环保局等等环保环境监测信息系统要求为准，可以无缝、灵活、低成本的方式适用于国家、省、市、区/县各级环境监测,是一个集现今计算机技术、信息技术、无线/有线网络技术、兼容GIS地理信息技术等等多种技术为一体的综合信息系统。网络结构图如下：
