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管理体制不完善。水利工程建设中涉及很多部门，但是在建设管理时，每一个部门的相关程序却不能相互兼顾，从中存在漏洞和缺陷，所以体制的不健全也会造成水利工程建设管理水平难以提高。例如:在产权的市场价值评估上，某县农田水利工程的产权市场评估就较为困难，不像其他不动产价值可以评估，可以用来抵押，可以出租。由于农田水利工程的价值是难以估量的，缺乏相应的评估人员，也缺乏市场交易，所以它的价值就很难被评判，因此也就很难去发掘和利用，终造成管理不善。
就以某县农田水利工程建设为例，由于某县的水利工程存在两部分，一部分是公共物品，一部分是私人物品，所以在对农田进行水利工程分类时，就要明确公共物品和私人物品。
水利工程建设人员素质不高。目前我国水利工程在项目建设管理方面，还是以农民为主的劳动力，这些人受到的教育水平低，在水利工程建设方面了解也不深入，所以整体建设人员的素质就较为低下，往往只能听从指挥和管理，所以这就造成水利工程建设在管理方面程度不强，水平不高，这也是水利工程建设与管理存在问题的原因。
近年来，我国在水利工程建设方面也在不断加强管理力度，加强水利建设市场管理，并进一步规范了水利工程建设的相关程序，着力推进水利的三项制度建设，也就是，法人的责任制，建设的监理制和招标制等。全面促进水利工程建设的健康发展，以此来实现经济体制的两个根本性变化。
对水利事业重视程度不足。我国是农业大国，水利工程是为重要的施工项目之一，然而，部分人员对水利工程建设重要性认识不足，导致水利工程建设受到一定的限制，欢迎有需要的朋友来电咨询
