环境卫生监测主要以环境为监测对象，运用生物的、物理的和化学的技术手段，通过测定影响环境质量因素的数值，对污染物的构成综合分析，研究其成分对环境质量影响的程度，终确定环境质量的变化趋势。
数据采集层
在排污口安装数据采集器，并通过标准接口如RS485或标准工控信号4~20m A 与相应的污染源在线监测仪器连接。数据采集器通过处理、统计监测仪器监测到的各类测量数据后，传送到中心。数据采集层采集到的数据信息是公共卫生环境监测管理系统获取监测数据的主要来源。
数据库层
该层包含不同类别的数据库，其完成的功能是将数据采集层采集到的庞大数据信息进行分类储存，储存与各类数据信息相对应的数据库中，以方面功能模块层对其储存的数据进行访问、分析、处理等。环保部门工作人员可通过网络操作网页服务器来处理数据采集层传送的数据，完成公共卫生环境监测系统的各项业务功能。从现场数据采集层传输过来的数据信息，会造成数据积累，庞大的数据信息会导致数据库查询等操作效率降低，因此，设计巧妙的数据库层，提高数据库使用效率，成为该系统设计的一个关键问题。
利用环境监测管理系统可以加强对环境污染监测数据的处理，能够快速有效的对公共卫生环境进行准确监测，从而使部门对污染源有更全面、更深入与更直观的把握，以提高对环境监测数据分析管理的科技水平。
