每类实验仪器的处理及消毒措施都有不同。严格的消毒灭菌工作极为重要，直接影响着整个实验能否顺利进行。因此保证实验室的实验仪器卫生安全问题一直以来受到广泛的关注。
实验室常用灭菌方式之干热灭菌：
常用于耐热器皿的灭菌，如移液管、玻璃平皿、玻璃或金属器皿等，可在170℃灭菌2-4h或200℃灭菌0.5-1h。接种环、接种针、涂布棒等实验器材可在酒精灯上直接进行灼烧灭菌。 灭菌效果：灭菌效果强，可杀灭包括芽孢在内的所有微生物。
注意事项：
1、干热灭菌过程的热穿透效果差且比较慢，因此在烘箱内进行干热灭菌时，不可摆放过满；
2、塑料、橡胶等不耐热材质不可采用此方法灭菌；纸张、棉花灭菌温度不能超过170℃；
3、制备好的培养基不可采用此方法灭菌。
玻璃器皿、塑料器皿和器械灭菌：
玻璃器皿可进行干热灭菌或高压蒸汽灭菌，但在蒸汽灭菌后及时烘干水分。
对不能进行高压蒸汽灭菌的塑料器皿可用75%酒精浸泡，使用前在无菌操作台面上晾干的同时，用紫外线重复杀菌。实验室还可以用环氧乙烷灭菌袋对塑料器皿进行消毒，消毒后的器皿要充分散气2～4小时后才可使用。
无菌操作所用的各种器械，一般采用干热或高压蒸汽灭菌，或用75%酒精浸泡，然后在无菌操作台面上晾干的同时再用紫外线重复杀菌；在使用期间可多次对其进行酒精灯火焰灼烧灭菌。
实验室不卫生隐患问题：
（1）在实验室当中的大部分实验员来自不同的生活环境，可能有一部分实验员缺少很好的自我卫生习惯，因此进入房间当中，所需要标本、模型让其操作道具，每一种模型会有很多人进行接触，标本在我们不知不觉当中已经变成了无形病毒的传播能够存在的介质，再加上某些实验员的不良习惯，尤其是部分实验员有吃食物的爱好，就能够使得病从口腔进入身体的情况出现。
（2） 实验室当中标本、物品很多，在实验员运用后，对于标本、模型采用置之不理得，能够使得标本以及道具沾染。
（3） 实验室的消毒仪器并不能进行全面杀毒灭菌，甚至一部分的实验室没有进行消毒杀菌仪器，如紫外线消毒灯、消毒柜、消毒室等消毒场所以及仪器。
（4） 实验室人员没有完全使用实验室制度来进行操作或者没有依照实验室的相关要求学生进行试验。
（5） 有些试验要求使用“菌罗”以及储存“菌落”的实验室不可以完全按照要求，在实验室操作实验员决定没有必要完全按照操作进行，因此对自我造成伤害。
实验室常用灭菌方式之高压蒸汽灭菌（湿热灭菌）
常用于实验室多数培养基灭菌，也可用于玻璃器皿、金属器皿的灭菌。一般采用121℃高压灭菌15-20min或116℃高压灭菌30min，根据培养基不同可对灭菌参数进行调整。 灭菌效果：可杀灭包括芽孢在内的所有微生物。
注意事项：
1、灭菌锅效力不达标、灭菌过程冷空气未排净、培养基本身含芽孢过多、灭菌方式不正确、灭菌锅内物品摆放过满都有可能导致灭菌失败；
2、在进行容器灭菌时，容器不可密封，需与灭菌锅内空气流通。
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