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如何确认RNA的质量
实时荧光定量PCR技术是通过测定RNA的转录水平来评估基因的活力。RNA样本提取的质量直接影响基因表达分析。影响RNA品质的因素有以下三种:RNA浓度、RNA纯度和RNA完整性。
检测RNA浓度、纯度和完整性的方式主要有以下几种:
紫外分光光度计法:
测量260nm吸收值计算RNA浓度,测量260nm/280nm吸收值的比值,用于评估RNA纯度。需要注意的是:在检测核酸物质时应该在固定的PH溶液中进行。
260nm/280nm的比值范围在 1.9~2.1 之间。<1.9,说明有蛋白质残留;>2.1,说明RNA可能发生降解。
琼脂糖凝胶电泳:
完整的RNA通常有三条带,zui亮的是28S条带,其次是18S条带,zui淡的是5S条带(部分试剂盒提取时会过滤掉5S条带)。通过琼脂糖凝胶电泳可以检测28S和18S的比值。该方法主要用于检测RNA的纯度和完整性。
如果28S和18S条带明亮、清晰、条带锐利,28S的亮度在18S条带的两倍以上,我们认为RNA的质量zui好。
若RNA条带出现弥散,病毒核酸纯化,原因可能:RNA被核酸酶降解、电压或电流过大、上样量过高或过低等。
总RNA的抽提方法:
目前常用的方法是用异硫qing酸胍苯1酚抽提法。
提取步骤:
先用液氮研磨材料,匀浆,加入Trizol试剂,进一步破碎细胞并溶解细胞成分。然后加入氯1仿抽提,离心,分离水相和有机相,收集含有RNA的水相,通过异丙1醇沉淀,获得比较纯的总RNA,用于下一步mRNA的纯化。也可将含有RNA样品的细胞破碎液通过硅胶膜纯化柱纯化。
RNA浓度和纯度判断:
OD260为1时相当于浓度为50 ug/mL;
OD260/0D280值在1.8~ 2.0之间,表示纯度较好;
0D260/OD280值低于1.8,样品有蛋白质或酚污染;
0D260/0D280值大于2.0,提取的RNA可能有降解;
电泳后如果rRNA大小完整,而且28S rRNA和18SrRNA亮度接近2:1、mRNA分布均匀,则认为RNA。
EXBio的T淋巴细胞增殖反应检测试剂盒(T-cell BlastoFlowEx Kit)#ED7642 旨在测量活化的全血样本中T淋巴细胞的增殖反应。 该试剂盒使用抗CD3和抗Ki67抗1体混合物检测增殖的淋巴细胞。
T淋巴细胞增殖反应检测试剂盒实验流程:
1.从培养箱中取出试管,取下并丢弃管盖。每管中加入25 ul EDTA溶液,混合。
2.在37℃下孵育10分钟。
3.加入2ml的PBS,混合。400g离心细胞5分钟,移除上清液。
4.轻轻摇动管子扰乱沉淀。加入2ml的稀释固定和裂解溶液,混合。室温下孵育10分钟。
5.400g离心细胞5分钟,移除上清液。
6.加入0.5ml稀释的破膜溶液,混合。室温下孵育10分钟。
7.加入2ml的PBS。400g离心细胞5分钟,移除上清液。
8.加入50 ul的CD3/Ki-67 PE抗1体预混液,混匀,室温下孵育至少30分钟。
9.加入2ml PBS。400g离心细胞5分钟,移除上清液。
10.用0.1-0.3ml的1%甲醛PBS溶液或者稀释的固定和裂解液(1份固定裂解液液 9份PBS的缓冲液)重悬细胞。在2-8℃下暗室条件下储存处理后的样品,直到分析。