环氧乙烷不会损害灭菌的物品且穿透力很强，一般可用于器械，塑料制品等不能采用高温灭菌的物品灭菌。例如，电子仪器、光学仪器、器械、书籍、文件、皮毛、棉、化纤、塑料制品、木制品、陶瓷及金属制品、内镜、透析器和一次性使用的诊疗用品等。环氧乙烷也是目前主要的低温灭菌方法之一。特别注意的是，含氯的物品以及能吸附环氧乙烷的物品则不宜使用环氧乙烷灭菌法。
采用环氧乙烷灭菌时，灭菌柜内的温度、湿度、灭菌气体浓度、灭菌时间是影响灭菌效果的重要因素。
有关节器械需求拆开，管腔类器械需求超声震动。所需灭菌物品、包装材料、生物指示剂要在相对湿度50%的房间内放置>2h，塑料制品需求更多湿化，包装前过夜湿化，但外表不能有肉眼水滴。
因为环氧乙烷是一种消毒灭菌效果较好的低温化学消毒剂，常温下穿透作用良好。由于环氧乙烷对畏热、畏湿和畏压的器械和卫生用品无损害，从20世纪50年代起就开始用于医院消毒。目前，发达国家的环氧乙烷灭菌已占灭菌总量的52.2%。
环氧乙烷灭菌器所 使用的灭菌方式，主要 应用于对那些不宜用其他方法灭菌的、热敏感的产品或部件。在制药行业中常用于无菌生产的部件和用品的灭菌，也用于给药器械的终灭菌，例如：环氧乙烷灭菌用于某些物品的无菌制造工艺，如塑料瓶或管、橡胶塞、塑料塞和盖。环氧乙烷灭菌用于有终包装的成品。这些产品主要是塑料或橡胶的给药器械。环氧乙烷灭菌也用于工艺设备，如在制造区内所使用的冻干机。含氯的物品及能吸附环氧乙烷的物品则不宜使用本法灭菌。气态环氧乙烷易燃易爆，应保持在特别的安瓿或耐压金属罐中。环氧乙烷灭菌器应安装在无菌环境中，距离压缩空气较近处。该环境中要设置排风扇，及时排除弥散在空气当中的环氧乙烷气体。用环氧乙烷灭菌的物品须用特制的标准纸塑包装。包内放指示卡。消毒日期一般为1-2年。如消毒各类物品，特别是各种管道必须保证干燥，防止因有水而达不到灭菌效果。凡油类物品严禁用环氧乙烷灭菌器灭菌。因达不到灭菌目的。
