诚信代理 Chemcraft正版软件教程
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行 业：IT 软件 财务行业管理ERP
发布时间：2021-06-01
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The "Tools/Build Z-matrix/" menu item allows one to obtain a Z-matrix in text format by clicking atoms in current structure and specifying some additional information (e.g., whether current parameter is an angle or a dihedral). Before using this utility one should preliminarily obtain the structure of the molecule in Cartesian coordinates. For more details, see here
“拖曳”原子或沿键旋转碎片的例子
当“拖动”原子或执行其他结构修改时，任何几何参数都可以控制在图像上（见图5）。Chemcraft的界面允许人们轻松地改变任何原子的类型或插入/移除一个键。Chemcraft提供了快速获取Z矩阵的实用工具。Z矩阵是通过点击分子中的原子并一些附加信息来建立的（图7）。在使用这个工具之前，首先应该在Cartesian坐标中获得分子的结构。所有用于构建分子的上述工具都可用于此目的。
Chemcraft可以调节分子中的原子坐标以应用特定的对称性（图8）。这个工具在研究中非常有用，因为对称分子比非对称分子计算得更快。
Chemcraft包含一组便于量子化计算的图形工具。它提供了方便的实用程序，有助于准备新的工作来计算和分析计算结果。其主要功能是对量子化学包生成的输出文件的可视化。主要支持的软件包是Gamess（美国版本和PCGamess）和Gaussian94-09。
构建分子
Chencraft支持一组用于构造分子结构的工具，这些工具可用于准备计算或其他目的的初始猜测：
从标准分子片段（自由基等）中构建分子，提供了通过自定义剪贴板来补充该片段集并通过剪贴板复制/粘贴单个片段的可能性；
修改分子中的任何几何参数（距离、角度、二面角）。该修饰可以伴随着一个原子、两个原子或选定的原子群的位移；
用鼠标在分子图像上拖曳原子或碎片或旋转碎片的可能性（图5）；
应用任意几何参数的迭代算法（图6）；
一种易于使用的实用程序，用于将点群应用于分子（图8）。
Chemcraft extracts molecular orbital coefficients together with basis set information from GAMESS-US output files and renders molecular orbitals in the form of isodensity surfaces or surfaces (planes, spheres) colored by density value (see fig. 3). Chemcraft provides some possibilities to perform operations with orbitals (e.g. to multiply one orbital by another). The formulas for building the orbitals are taken from the source code of PLTORB program distributed with GAMESS-US. The computation of cubes with density values is well-optimized. Note that if there are several tables of molecular orbital coefficients in the file, Chemcraft extracts each of them and allows them to be rendered (for instance, in MCSCF calculations either canonical or natural orbitals can be shown). Besides visualization of orbitals, Chemcraft provides a simple utility for automatic determination of atomic orbitals forming each molecular orbitals, which can be useful for analysis of the orbitals.
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