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关 键 词:销售sequencher正版软件
行 业:IT 软件 网管及备份软件
发布时间:2021-04-28
科学软件网提供的软件覆盖各个学科,软件数量达1000余款,满足各高校和企事业单位的科研需求。此外,科学软件网还提供软件培训和研讨会服务,目前视频课程达68门,涵盖34款软件。
Perform SNP analysis, Methylation analysis, or RNA A-to-G tolerant alignment in a few steps.
Import a sequence in GenBank format and its feature table will be applied to the sequence, and mark it as a Reference Sequence. Assembling to the Reference Sequence means you are able to compare your reads to the archetypal Reference Sequence. If you are working with multiple samples from different sources you can even use Assemble by Name to automate your work.
Sequencher DNA序列分析软件是科学家们必备的工具。持续发展和改进超过25年,Sequencher提供了无与伦比的功能特征,成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以少的时间投资产生结果,而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法,可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。
BMA
BWA是Sequencher v5.2时添加到插件家族中的。Sequencher使用BWA-MEM, BWA软件包包含了快新的算法。BWA-MEM被设计为对齐70bp到1Mbp的序列读数到参考序列中。BWA在命令行中运行。Sequencher为您提供了一个易于使用的接口,它可以使您与命令行隔离,并且不必学习或使用命令行参数。用户想要访问这些命令行函数,Advanced (Edit)对话框也允许您使用这些命令行。
GSNAP
GSNAP是Sequencher v5.0被添加到插件家族中。GSNAP使用压缩参考序列的基准参考对准的方法。当执行Next-Gen序列时,让GSNAP可以更快更简单。
GSNAP被设计用来执行Illumina-Solexa的基于参考对准和Sanger标准数据,这个标准数据是成对结尾或未成对结尾的。在GSNAP中,序列的长度不是问题,因为它可以在非常短的时间内与任意长的数据长度对齐。GSNAP可以处理Multiplex ID(MID)数据,从而进一步提高工作效率。Sequencher友好的界面允许您使用MID数据来发挥GSNAP的功能。Sequencher自动将数据按条形码分割成单独的文件,使用GSNAP将它们与引用对齐,并将结果放入单独的结果文件夹中。
用GSNAP进行任何对齐的结果可以在流行的Tablet浏览器中查看。
We also added the charts you would expect to see, such as the Volcano plot, so you can view the results without resorting to the command line. Because we know you have your own favourite aligners we donÔÇÖt insist you use ours. As long as your aligner creates SAM or BAM as its output you are ready to explore your data with one of the most widely regarded RNA-Seq tools available.
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