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关 键 词:ChromasPro软件使用教程
行 业:IT 软件 软件加密
发布时间:2021-04-12
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ChromasPro是一款好用的DNA测序图谱软件,软件主要适用于的生物学人员使用,软件适用于测序的项目可以高达几百万碱基,并拥有实用的基本序列编辑、序列分析、生成限制位点和片段图以及搜索序列等多种功能,是您进行研究的好帮手。
以应用生物系统、Staden色谱图(SCF)、MegaBace (esd)、FASTA、EMBL、GenBank、SwissProt,、GenPept、GCG RSF和纯文本格式打开和保存序列。
将重叠序列组装一致,自动显示含糊不清的序列并编辑。
用高质量数据自动消除低质量序列并提高序列。
查看检测基因型文件。
ChromasPro DNA序列分析软件
使用参考序列作为组装的支架。
生成限制位点和片段图,并列出切割,非切割和片段。
映射开放阅读框,由G+C框架图,并用一次点击翻译ORFs。
打印色谱图,限制位点和片段图,和开放阅读框架图。
通过NCBI进行核苷酸和蛋白质BLAST搜索。
与ClustalW接口执行多个对齐。
反向互补序列和色谱图。
Added 32-bit version to installer.
Added an option to show statistical information for a contig.
Pressing the up arrow in row one of the alignment moves the cursor to the consensus.
Shift+mousewheel scrolls the alignment or aligned chromatograms.
Fixed bug which prevented consensus recalculation after removing an aligned sequence at the 5′ end.
Fixed bug which could leave unnecessary gaps if more than 1 base was deleted from an aligned sequence at once.
Fixed rare error when undoing a large consensus deletion at the 5′ end spanning the entire first aligned sequence.
Fixed the scroll range sometimes initially being a few bases short.
ChromasPro适用于DNA序列组装项目,可达到几兆字节,并进行基本序列编辑和分析。它能够从Sanger序列器,比如ABI,454和Illumina下一代序列器中组装数据,如果有8GB的可用内存,则多可组装1,000,000个序列。
ChromasPro具体功能
打开Applied Biosystems .ab1, Staden Chromatogram (SCF and ZTR), 454 SFF, FASTA, FASTQ, EMBL, GenBank, SwissProt, GenPept, GCG RSF和纯文本格式中的序列。
以.ab1, .scf, .fasta 和.fastq格式保存序列。
使用图形界面组装重叠序列,生成一致性并突出模糊性进行编辑。
使用高质量数据自动去除低质量序列以改进序列组装。
使用参考序列作为组装的支架。
生成限制位点和片段图,并列出切割,非切割和片段。
映射开放阅读框,由G+C框架图,并用一次点击翻译ORFs。
打印色谱图,限制位点和片段图,和开放阅读框架图。
通过NCBI进行核苷酸和蛋白质BLAST搜索。
与ClustalW接口执行多个对齐。
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