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关 键 词：GPMAW正版软件教程
行 业：IT 软件 支票打印
发布时间：2021-04-09
科学软件网是一个以引进国研软件，提供软件服务的营业网站，网站由北京天演融智软件有限公司创办，旨在为国内高校、科研院所和以研发为主的企业事业单位提供的科研软件及相关软件服务。截止目前，科学软件网已获得数百家国际软件公司正式授权，代理销售科研软件达一千余种，软件涵盖领域包括经管，仿真，地球地理，生物化学，工程科学，排版及网络管理等。同时，还提供培训、课程（包含34款软件，66门课程）、实验室解决方案和项目咨询等服务。
序列处理:通过在Entrez和本地数据库(FastA格式和Swiss-Prot)中直接搜索数据库，从许多不同格式的序列中导入序列。序列可以保存在本地(数据库)中，以备将来参考。从序列窗口可以执行大量操作。序列可以以FastA格式导出(单个序列或同时导出所有序列)，以便于传输到其他程序。
质量分析:蛋白质可以通过自动方法(如定义酶作用的灵活命名法)或手动方法进行裂解。多肽显示与许多参数(各种质量值- mono, ave，电荷- Bull&Breese指数，HPLC指数，pI，电荷)，并可以进一步工作(如交联，新的分裂)。
生物信息学:可显示多种图形、疏水性、点图、二级结构预测。可以在本地数据库上执行BLAST搜索。使用ClustalW的多重对齐。CustalW可执行文件现在是GPMAw包的一部分，但是在以前的版本中，您必须自己安装。
序列窗口
序列窗口是GPMAW的核心窗口并默认显示一个序列。从这里，您可以调用大多数与序列相关的函数（通过菜单、工具栏或弹出菜单）。
Sequence handling: Import of sequences from a number of different formats with direct database search in Entrez and in local databases (FastA format and Swiss-Prot). Sequences can be saved in local files (databases) for future reference.
From the sequence window a large number of actions can be performed. Sequences can be exported in FastA format (either singly or all sequences at once) for easy transfer to other programs.
显示1个或3个字母
平均质量/单同位素质量
固定残留物宽度
带有序列信息的提要栏
显示二硫化物桥、改性残留物等
通过突出显示部分序列，您可以轻松获得给定肽的质量。为了便于导航，您可以使用特定颜色的残留物（提供三种不同颜色和下划线）。大多数设置可以很容易地在系统设置框中预先设置。
序列窗口形成父窗口，从中可以创建大量派生子窗口：
肽窗口
MS/MS窗口
批量搜索、合成搜索
图表：疏水性、二级结构、电荷与酸碱度、点图、α螺旋轮
肽窗口
肽窗口通常通过自动摘要命令从序列窗口中调用。但是，也有其他方法，如手动或半自动分裂。
Sequence window
The sequence window is the central window of GPMAW and default view of a sequence. From here you can call most of other sequence related functions (either through the menu, the toolbar, or the pop-up menu).
Main toolbar – Seach & cleavage section:
The local executable version of ClustalW is available from a large number of sources on the web, but this is one of the official sites:
当前的局限
如果修改了带电残留物，则原始pka值仍作为总pi/电荷的一部分进行计算。如果未充电的残余物变为带电的残余物并pka值，则计算“正确”。如果一个界点被修改，它仍然会产生π/电荷。
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