Array Designer中文版使用教程 正版软件
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行 业:IT 软件 远程控制软件
发布时间:2021-04-08
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针对特定设计的BLAST搜索
Array Designer通过解释针对在NCBI或本地自定义数据库中可用的任何基因组数据库进行的BLAST搜索结果来设计特定性的寡核苷酸。在设计寡核苷酸时,任何具有显著同源性序列以及重复区域都会被自动排除。
排序阵列
Array Designer设计的重新排序阵列可用于大量样品中的SNP及其他序列变检测。重测序阵列设计中的常见问题之一是由于模板内部杂交造成的碱基错配。由于BLAST的独特性能,可以识别和避免产生假阳性的同源区域。
Array Designer可以在数秒内为寡核苷酸和cDNA微阵列设计数千个引物和探针。设计了SNP检测、微阵列基因表达和基因表达谱的探针。此外,还全面支持拼接数组和和重新排序数组。
针对特定设计的BLAST搜索
Array Designer通过解释针对在NCBI或本地自定义数据库中可用的任何基因组数据库进行的BLAST搜索结果来设计特定性的寡核苷酸。在设计寡核苷酸时,任何具有显著同源性序列以及重复区域都会被自动排除。
全基因组阵列
通过Array Designer,可以通过检测整个基因组中每个基因或外显子,轻松研究整个生物体的基因组成。这很容易发现个体或群体和比较基因组杂交(CGH)中的差异和个转录本、SNPs、DNA序列变异。
拼接阵列
您可以指出全基因组序列中的每一个碱基,也被称为全基因组扩增,避免重复区域。调控因子表征,研究表观遗传修饰、甲基化模式和蛋白结合位点,这些以前比较难的阵列设计现在都可以简单的完成。
排序阵列
Array Designer设计的重新排序阵列可用于大量样品中的SNP及其他序列变检测。重测序阵列设计中的常见问题之一是由于模板内部杂交造成的碱基错配。由于BLAST的独特性能,可以识别和避免产生假阳性的同源区域。
A PCR Primer Design software to design high amplification efficiency primers by automatically avoiding homologies and template secondary structures
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