产品规格:
产品数量:
包装说明:
关 键 词:chemcraft报价
行 业:IT 软件 教学管理软件
发布时间:2021-03-14
Chemcraft包含一组便于量子化计算的图形工具。它提供了方便的实用程序,有助于准备新的工作来计算和分析计算结果。其主要功能是对量子化学包生成的输出文件的可视化。主要支持的软件包是Gamess(美国版本和PCGamess)和Gaussian94-09。
Chemcraft对于Gamess用户
Chemcraft给Gamess-US输出文件提供了非常详细的可视化。文件中的下列数据可以以图形方式呈现:
原子坐标(对应于所有或对称的原子,如果在文件中呈现对应的表);
如果文件中给出了键阶分析,文件中的结合物显示在图像上(否则通过距离算法计算结合物);
能量梯度可以以指针的形式显示(图2);
不同的原子属性可以以标签的形式显示:Mulliken种群和电荷、自旋密度、价态;
键序(以标签的形式显示在结合物上);
分子轨道可视为等值面或彩色平面;
振动模式可以动画或以指针的形式(位移矢量)显示;
偶极矩可视为指针;
MO能量可以以数字形式显示。
构建分子
Chencraft支持一组用于构造分子结构的工具,这些工具可用于准备计算或其他目的的初始猜测:
从标准分子片段(自由基等)中构建分子,提供了通过自定义剪贴板来补充该片段集并通过剪贴板复制/粘贴单个片段的可能性;
修改分子中的任何几何参数(距离、角度、二面角)。该修饰可以伴随着一个原子、两个原子或选定的原子群的位移;
用鼠标在分子图像上拖曳原子或碎片或旋转碎片的可能性(图5);
应用任意几何参数的迭代算法(图6);
一种易于使用的实用程序,用于将点群应用于分子(图8)。
Chemcraft extracts molecular orbital coefficients together with basis set information from GAMESS-US output files and renders molecular orbitals in the form of isodensity surfaces or surfaces (planes, spheres) colored by density value (see fig. 3). Chemcraft provides some possibilities to perform operations with orbitals (e.g. to multiply one orbital by another). The formulas for building the orbitals are taken from the source code of PLTORB program distributed with GAMESS-US. The computation of cubes with density values is well-optimized. Note that if there are several tables of molecular orbital coefficients in the file, Chemcraft extracts each of them and allows them to be rendered (for instance, in MCSCF calculations either canonical or natural orbitals can be shown). Besides visualization of orbitals, Chemcraft provides a simple utility for automatic determination of atomic orbitals forming each molecular orbitals, which can be useful for analysis of the orbitals.
在使用该实用程序之前,应该选择几个原子以大程度地彼此靠近(图9这些原子标记为白色)。除了这个特性,Chemcraft还可以计算两个分子之间的均方根差值。
Chemcraft从Gamess-US输出文件中提取分子轨道系数和基组信息,以等密度面的形式呈现分子轨道或由密度值着色的表面(平面、球体)(参加图3)。Chemcraft提供用轨道执行操作的一些可能性(例如将一个轨道乘以另一个轨道)。创建轨道的公式取自GAMESS-US分发的PLTROB程序的源代码。用密度值计算立方体能被很好地优化。注意,如果文件中有多个分子轨道系数表,Chemcraft可以提取它们中的每一个并允许它们被渲染(例如,在MCSCF计算中,可以显示规范或自然轨道)。除了轨道的可视化,Chemcraft还提供了一个简单实用的工具,用于自动确定原子轨道形成每个分子轨道,这对分析轨道很有用。