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色泽观察：色泽要纯正，而且上下一致，否则不可使用。通过色泽观察可判断菌种的老幼和有无污染发生。老化的原种常出现老皮、黄水、斑块、菌体干缩。污染过霉菌的菌种，能从其表面看到污染的菌落，即使是这些菌落已被食用菌遮盖，如果仔细观察，仍能看到其足迹。如果污染菌的菌落在表面，可看到食用菌菌丝下它的本来颜色，或表现为表面食用菌气生菌丝不均匀；如果污染菌的菌落形成在菌种体周围，可以看到污染菌的菌落与食用菌菌丝之间的明显的黄色的拮抗线。有的食用菌毛霉菌污染后，黑龙江食用菌，仍能继续生长，如平菇，食用菌液体菌种，并将毛霉菌的菌丝和孢子囊都能遮盖住，食用菌培训，一旦菌种长满后，没有经验的人常把这样的菌种作为正常菌种。在这种情况下，仔细观察，可见到菌丝分布较乱，且色泽较暗或稍黄，没有正常菌种那样整齐鲜亮饱满的外观。
取出检查：购买原种时，最‘好能取出有代表性的菌种，开盖挖出，一是闻气味，是否有浓郁的菇香味；二是看菌丝是否连接紧密。如果菇香味清淡或菌丝连接不紧（挖取时手感很松散，不需费劲就可将菌种打碎挖出），均不是优良原种。
