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MGIEasy RNA Exome应用主要用于人源样本的RNA编码区定量分析,该应用整合了RNA方向性文库制备和子捕获技术,将人源total RNA转化成已知RNA链起源方向的双链DNA分子,然后对其子序列进行特异性捕获,终制备成适合于MGI高通量测序仪测序的文库,为FFPE 样本和其他低质量人源样品的mRNA表达定量测序分析提供了一种、完整的产品组合。
MGIEasy RNA Exome应用专注于降解样本的RNA编码区的定量分析,从total RNA中捕获RNA编码区,有助于大限度地提高mRNA定量的性,且相比于非RNA Exome测序,达到相同的RNA编码区测序深度时所需的测序数据量更少。
MGIEasy RNA Exome应用产品包含了MGIEasy RNA方向性文库制备试剂套装(1000006385)、MGIEasy 子组捕获V5探针试剂套装(940-000187-00)和MGIEasy 子组捕获试剂盒(1000007743),本建库操作指南将为您详细介绍MGIEasy RNA Exome文库的制备技术。
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样本低投入量
Total RNA起始量可低至10 ng,且在不同起始量下文库均有出色、稳定的数据表现。
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对严重降解低质量样本也能适用
针对FFPE样本和其他降解严重的低质量样本也能适用,可以获得量数据。
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专注于RNA编码区的定量分析
通过子捕获的方式获得RNA编码区,Exon比例达60%以上,相同的RNA编码区depth所需数据量更少。
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的重复性
低质量样本建库重复性可达0.99以上。
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| 应用名称 |
MGIEasy RNA Exome |
| 应用指导 | MGIEasy RNA Exome 建库操作指南 |
| 所需试剂盒信息 |
MGIEasy RNA方向性文库制备试剂套装 MGIEasy 子组捕获V5探针试剂套装 MGIEasy 子组捕获试剂盒 |
| 规格 |
16 RXN |
| 所需样本量 | 10 ng-100 ng total RNA |
| 样本类型 | 冰冻组织、FFPE样本 |
| 适用物种 | 人 |
| 建库时间 |
32 h |
| 应用方向 |
RNA-Seq |
| 适用的测序平台 |
MGISEQ-2000 |
| 的测序读长 |
PE100 |
| 的测序深度/Raw reads数 |
PE100 / 25M reads |