诚信代理 Beacon designer怎样用
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关 键 词:Beacon,designer怎样用
行 业:IT 软件 教学管理软件
发布时间:2023-02-23
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HRMA试验设计
Beacon Designer为突变检测提供了一个综合解决方案。高分辨率熔解分析(HRMA)是一种比基于前列腺的基因型分析更具有成本效益的方法。该程序使用专有算法,可以设计出检测突变的佳引物。
高分辨率的熔解分析引物被设计成侧翼感兴趣突变,产生具有可检测的熔融温度变化的短可能的扩增子。引物设计避免了模板二级结构,保证有效引物延伸。设计的HRMA引物可以在NCBI的核苷酸数据库中进行搜索,以检验其特。还可以对预先设计或发布的引物进行分析。
自动化实时PCR引物和探针设计
Beacon Designer可以自动设计实时引物和探针。它被世界各地的分子生物学家用来设计成功的实时PCR分析。它节省了很多失败的实验所浪费的时间和金钱。Beacon Designer是实时引物和探头设计的灵活的解决方案。
具体而有效的设计:Beacon Designer如何使其成为可能
您可以在程序中使用BLAST搜索序列并搜索模板结构。在设计引物和探针时使用这两种搜索的结果。在设计过程中,会自动避免出现明显的交叉同源性和模板结构的区域。
HRMA试验设计
Beacon Designer为突变检测提供了一个综合解决方案。高分辨率熔解分析(HRMA)是一种比基于前列腺的基因型分析更具有成本效益的方法。该程序使用专有算法,可以设计出检测突变的佳引物。
高分辨率的熔解分析引物被设计成侧翼感兴趣突变,产生具有可检测的熔融温度变化的短可能的扩增子。引物设计避免了模板二级结构,保证有效引物延伸。设计的HRMA引物可以在NCBI的核苷酸数据库中进行搜索,以检验其特。还可以对预先设计或发布的引物进行分析。
双标记探针的设计
Beacon Designer目前支持四种基于探针的化学物质:
TaqMan探针
Beacon Designer 为qPCR检验设计和的oligos
自动化实时PCR引物和探针设计
Beacon Designer可以自动设计实时引物和探针。它被世界各地的分子生物学家用来设计成功的实时PCR分析。它节省了很多失败的实验所浪费的时间和金钱。Beacon Designer是实时引物和探头设计的灵活的解决方案。
Specific and Efficient Design: How Beacon Designer™ Makes it Possible?
You can BLAST search sequences and search for template structures from within the program. The results of both these searches are used while designing primers and probes. The regions that exhibit significant cross homologies and template structures are avoided automatically during the design.
Salient Features Supported for MethyLight Assays in Beacon Designer™
a) Prediction of CpG islands in the DNA sequence.
b) Design methyl specific primers and TaqMan® probes.
c) Design suitable control primers and TaqMan® probes for corresponding unmethylated and untreated sequences.
d) Analyze pre-designed/published primers and/or TaqMan® probes and design of compatible oligos.
e) Primers and TaqMan® probes are designed by avoiding regions of homology identified by automatically interpreting BLAST search results.
具体而有效的设计:Beacon Designer如何使其成为可能
您可以在程序中使用BLAST搜索序列并搜索模板结构。在设计引物和探针时使用这两种搜索的结果。在设计过程中,会自动避免出现明显的交叉同源性和模板结构的区域。
功能特征
SYBR Green引物设计
TaqMan探针设计
多路实时PCR检验设计
HRMA引物设计
MethyLight TaqMan设计
分子信标的设计
NASBA检验设计
FRET探针设计
Scorpions设计
避免交叉同源性-针对特定的Oligo设计
避免模板结构——提高引物效率
Oligo评级
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