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深圳FFPE提取 兼容手动提取及自动化提取 简单 快速
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南京兔牙生物科技有限公司
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关 键 词:深圳FFPE提取
行 业:化工 化学试剂
发布时间:2022-07-25
FFPE样本DNA提取试剂盒能配合裂解试剂释放组织中的DNA,再通过快速磁响应结合到磁珠表面,获取高度纯化的基因组DNA。
FFPE样本DNA提取试剂盒提供了一种快速提纯方法,可在短短时间内从福尔马林固定的FFPE组织样品中分离和纯化总RNA。由于使用福尔马林固定组织导致RNA和蛋白质的交联,并且嵌入组织样品的过程也可导致RNA随时间的破碎。FFPE样本DNA提取试剂盒允许逆转部分福尔马林的修饰,从而获得高质量和高产量的RNA。该试剂盒能够净化所有大小的RNA,从大的mRNA和核糖体RNA到microRNA和小干扰RNA,取决于FFPE组织的年限,因为已知RNA的碎片化会随着时间的推移而发生。
储存条件:
磁珠悬浮液和蛋白酶K置于2-8℃保存,其他试剂可室温保存,有效期12个月。
FFPE样本DNA提取试剂盒的常见问题分析及解决方法:
从前处理、提取、建库到测序分析,FFPE样本常见问题复杂多样,其中绝大部分问题和样本直接相关,可以通过回溯实验过程及分析来优化实验。
1、文库复杂度低
原因:样本质量差:测序深度太高;
优化方法:规范前处理、核酸提取过程;检查设备状态等;调整测序深度。
2、文库片段短
原因:样本质量差;打断时间过长
优化方法:规范前处理;调整打断时间。
3、文库总量低
原因:核酸投入/杂交投入量低;样本质量差;实验操作不规范;
优化方法:投入足够量的核酸,规范实验操作。
福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)是组织样本常见的保存方式,FFPE样本DNA提取试剂盒采用具有特有分离作用的纳米磁珠和特制的缓冲液系统,可从FFPE样品中提取高质量的基因组DNA。
FFPE样本DNA提取试剂盒的操作过程便捷,提取的核酸得率高,质量稳定可靠,可供PCR、实时荧光定量PCR、二代测序等使用。FFPE样本DNA提取试剂盒是基于磁珠法的分离系统,适用于高通量的自动化提取流程。
FFPE样本DNA提取试剂盒提供了从福尔马林固定的石蜡包埋(FFPE)组织样品中分离和纯化DNA的快速方法。使用此试剂盒可以获得高质量和高产量的DNA,而且可在较短时间内完成。纯化的DNA具有高产率和完整性,不含抑制剂,可用于多种下游应用,包括qPCR,突变筛选,微阵列分析,测序,单核苷酸多态性(SNP)和STR基因分型。
疾病研究和病理分析中,由于通过手术、穿刺等方式处理的组织样本离开机体后,很快就会发生腐烂及组织,丧失原有正常的结构和功能。因此,离体的组织要经固定、石蜡包埋、切片及染色等步骤以避免细胞组织,进而进行形态结构分析及*或分子分析等。比如应用FFPE样本DNA提取试剂盒处理组织结构。
FFPE样本的特点:FFPE样本,即用福尔马林固定、石蜡包埋的组织样本。因其能更好地维持组织细胞的结构,便于研究及更好地保存样本,该方法已经被普遍应用。组织样本在前处理中的不规范操作,可能会导致不同程度的DNA损伤,影响NGS检测。
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