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微生物鉴定系统：微生物鉴定系统的工作原理因不同的仪器和系统而异。不同的细菌对底物的反应不同是生化反应鉴定细菌的基础，而试验结果的准确度取决于鉴定系统配套培养基的制备方法，RNA微生物筛查原理、培养物浓度，RNA微生物筛查原理、孵育条件和结果判定等。大多微生物鉴定系统采用细菌分解底物后反应液中pH的变化，色原性或荧光原性底物的酶解，测定挥发或不挥发酸，RNA微生物筛查原理，或识别是否生长等方法来分析鉴定细菌。药敏试验分析系统的基本原理是将微量稀释在条孔或条板中，加入菌悬液孵育后放入仪器或在仪器中直接孵育，通过测定细菌生长的浊度，或测定培养基中荧光指示剂的强度或荧光原性物质的水解，观察细菌的生长情况。在含有培养基中，浊度的增加。微生物鉴定的传统的鉴定方法普遍使用。RNA微生物筛查原理
基因芯片技术是通过微电子技术和微加工技术，将海量的基因寡核苷酸进行高密度且有序排列，使其排列在纤维膜和硅片等载体上，从而形成信息检测芯片。采用基因芯片技术对检测样品DNA经过PCR技术扩增后制备的探针点样在基因芯片的表面，经过荧光标记的寡核苷酸点和芯片表面的探针进行杂交，然后使用扫描仪对芯片上的荧光分布进行分析，从而确定样品微生物DNA中是否有某些特定的微生物。基因芯片检测技术还可在寡核苷酸的探针中添加相应探针，借此在一定程度上扩大检测范围，同时通过添加并调整探针使基因芯片检测的准确性得以提升。从理论上来说，利用基因芯片技术可在一次试验中有限检测出全部潜在致病原，或者在一张基因芯片中检出一种治病原的遗传学指标，使基因芯片技术检测的速度、灵敏度以及便捷性等得到提升，解决传统操作的自动化程度低、效率低以及操作复杂等问题。RNA微生物筛查原理室内空气是微生物污染的传播途径。
传统病原微生物检测方法：随着医学微生物学研究技术的不断发展，病原学诊断已不再局限于病原体水平，深入到分子水平、基因水平的检测手段不断出现并被应用于临床和实验。核酸分子杂交技术、PCR技术、基因芯片技术、高通量测序技术等检测方法，自动化程度高，快速省时、无污染、结果精确，可以准确灵敏地鉴定病原微生物。传统的病原微生物的检测方法有：直接涂片镜检、分离培养与生化反应、组织细胞培养、血清学与*学检测、血清学与*学检测、基因检测（核酸杂交技术、基因芯片技术、PCR技术、环介导恒温核酸扩增法等）。
我们食品微生物检测过程中，除了我们知道要检测的目标微生物之外，往往会出现一些和目标微生物表现不一，但你又想知道它是什么菌属的情况，特别是对于一些生产企业，有时候往往会怀疑是否是因为这个“非目标菌”的存在，从而影响到了产品质量。那怎么去鉴定那些“非目标”微生物呢？又有哪些方法和手段可以采用呢？传统的细菌系统分类，也就是常说的鉴定，通常是通过纯培养分离后从形态学、生理生化反应特征以及*学特性（血清学分析）进行鉴定。这也是我们目前国标中常用的鉴定手段，这种方法的优点就是所用试剂简单易得，常规实验室即可展开，经济实用，缺点呢，就是鉴定所需时间较长，且容易判断不准确。用这种方法，要先进行革兰氏染色，从镜检分析其可能的微生物种属，再根据判断结果，按照《伯杰氏手册》上的生化项目进行实验，确定其可能的微生物种属。比如，镜检是革兰氏阳性杆菌，且周围或菌体*有芽孢产生，这时候我们就要往芽孢杆菌的方向去进行生理生化鉴定。微生物鉴定的传统的鉴定方法虽然仍被普遍使用。
微生物鉴定的方法：1.从观察显微镜下甚至光镜下的微生物的的那个细胞的形态，比如说，是球菌，还是杆菌，还是弧菌，还是螺旋菌，这都是可以从微生物的单个细胞形态上区分的。还有就是细胞的形态，比如说是否有鞭毛、芽孢之类的东西，都是微生物鉴别的特征性特征。2.就是观察细菌的菌落形态，因为细菌生长繁殖到一定阶段大多都是以菌群的形态存在的，不同的细菌菌落在不同的培养基上的生长情况不同，部分细菌对培养基要求较高，部分培养基只能在特定的培养基上生存，通过微生物对不同类型培养基的适应性，可以起到对菌种的有效区分。快速检测方法是指从样品制备到出具检测结果的整个检测过程能够在短时间内完成的检测方法。RNA微生物筛查原理
病毒是颗粒很小、以纳米为测量单位、结构简单、寄生性严格，以复制进行繁殖的一类非细胞型微生物。RNA微生物筛查原理
微生物检测的方法：计数器测定法即用血细胞计数器进行计数。取一定体积的样品细胞悬液置于血细胞计数器的计数室内，用显微镜观察计数。由于计数室的容积是一定的(0.1mm3)，因而根据计数器刻度内的细菌数，可计算样品中的含菌数。本法简便易行，可立即得出结果，不只适于细菌计数，也适用于酵母菌及霉菌孢子计数。电子计数器的工作原理是测定小孔中液体的电阻变化，小孔只能通过一个细胞，当一个细胞通过这个小孔时，电阻明显增加，形成一个脉冲，自动记录在电子记录装置上。该法测定结果较准确，但它只识别颗粒大小，而不能区分是否为细菌。因此，要求菌悬液中不含任何碎片。RNA微生物筛查原理