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食物中的α—亚麻酸主要经肠道直接吸收，在肝脏贮存，经血液运送至身体各个部位，直接成为细胞膜的结构物质。其次，α—亚麻酸作为ω—3系多不饱和脂肪酸的母体，在碳链延长酶和脱酶的作用下，经碳链延长和去饱和可以代谢产生多种高活性物质，其中最重要的有EPA和DHA、EPA是三系前列腺素的前体物质，在脂氧化酶和环氧化酶的作用下生成PGE5、PGI3、LTB5、TXA3等活性物质，调控机体诸多的生化反应，而DHA(俗称脑黄金)则是大脑、神经、视网膜等组织的主要结构物质。有论文报道，老年人体内碳链延长酶和脱酶的活性可能降低而导致DHA和EPA的合成不足，但亦有实验证实没有明显的差异。α—亚麻酸作为生长、细胞代谢及肌肉运动供能只是其功能的一部分，其更多是作为结构物质和代谢调控物质，发挥结构功能和调控功能。
